蛋白质-配体对接
预测底物或候选药物等小分子与已知三维结构受体的结合方式。
AutoDock
Welcome to AutoDockAutoDock 是一套自动化分子对接工具，用于预测底物或候选药物等小分子如何与具有已知三维结构的受体结合。站点提供 AutoDock4、AutoDock Vina、AutoDockTools 以及配套方法、文档和资源。
- 4.2.6
- AutoDock4 最后修订版本
- 2
- AutoDock4 的核心程序：autodock 与 autogrid
- 7
- 页面列出的应用方向
覆盖蛋白质-配体对接流程的工具与方法
从网格预计算、配体对接到结果分析，AutoDock 提供适用于结构基础药物设计和相关研究的工具，并支持多种对接应用场景。
受体网格计算
AutoGrid 可预先计算描述目标蛋白的网格，供 AutoDock4 进行对接使用。
快速内部网格计算
AutoDock Vina 会在内部计算所需原子类型的网格，无需预先选择原子类型和生成网格图。
图形化设置与分析
AutoDockTools（ADT）可帮助设置配体可旋转键并分析对接结果。
多种研究应用
支持结构基础药物设计、先导化合物优化、虚拟筛选、组合文库设计、蛋白质-蛋白质对接和化学机制研究等方向。
新一代对接引擎
页面介绍了 2021 年至今持续发展的 AutoDock-GPU 与 AutoDock Vina v1.2.x，并指出相关方法已在新引擎中得到改进和重新实现。
AutoDock-GPU 持续发展
页面将 AutoDock-GPU 列为 2021 年至今持续发展的新一代对接引擎，并提供其项目入口。
AutoDock Vina v1.2.x 持续发展
页面介绍 AutoDock Vina v1.2.x 为 2021 年至今持续发展的对接引擎，相关方法已结合改进重新实现。
下载、文档与扩展工具
通过官方资源页面可获取 AutoDock4、AutoDockTools、Raccoon、AutoLigand、AutoSite、共价对接、含水对接及 AutoDock Zn 等内容。
从这里开始使用AutoDock。
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